Flexin pääkäyttöliittymää käytetään tietokoneen selaimella. Pääkäyttöliittymä ei ole responsiivinen eikä sitä suositella käytettäväksi tabletilla tai älypuhelimella.
Pääkäyttöliittymä on tarkoitettu konttorikäyttäjille. Pääkäyttöliittymästä löytyy kaikki työnjohtoon sekä laskutukseen liittyvät toiminnallisuudet. Myös omien tietojen tarkastelu ja konfiguraatio tehdään pääkäyttöliittymässä.
HUOM: Työntekijä- tyyppisillä resursseilla ei ole pääsyä pääkäyttöliittymään. Heidän tulee käyttää joko sovellusta tai selain-mobiilia.